Выдающийся экономист и управленец с многолетним опытом работы в сферах экономики и здравоохранения. Его профессиональная карьера началась в 90-е годы в качестве главного бухгалтера техникума в г. Байконур, где он не только освоил экономические процессы, но и активно внедрял образовательные программы, создав Курсы бухгалтеров с использованием программы 1С бухгалтерия учета РФ. Этот опыт стал основой для его дальнейшего карьерного роста в Астане.
В Астане Елмагамбетов занял ключевые позиции в системе здравоохранения. Работал заместителем директора по экономическим вопросам ГККП «МЦППЗ», возглавлял Департамент планирования, финансирования и государственных закупок в РГП РЦРЗ и занимал пост главного специалиста по внутреннему контролю. Позднее, в качестве проректора по экономическим вопросам в ТОО «Республиканский институт последипломного обучения врачей», он активно реформировал экономическую составляющую образовательных учреждений.
С 2013 года Елмагамбетов занимает пост исполнительного директора Общественного объединения «Республиканская медицинская палата». В 2015 году он основал ТОО «Республиканский центр профессионального развития “Санат”», ныне известный как Национальный научный центр развития образования “Санат”, где он по-прежнему является генеральным директором. Под его руководством центр достиг международного признания и стал лидером в области профессионального образования.
В 2018 году Елмагамбетов основал ОЮЛ «Казахстанская ассоциация содействия развитию образования» и журнал «Профессиональное развитие». Благодаря его усилиям были учреждены награды за вклад в развитие профессионального образования и здравоохранения, организованы школьные олимпиады и поддержаны научные исследования. Одним из последних достижений стало создание сертификационных курсов по специализации “Фармация”, что укрепляет позиции Казахстана на международной научной и образовательной арене.